L'histoire debute en CE75 .
Aprés la tragedie des 3 plants detruits et de la Terre en CE73 , les naturels et les coordinateurs en finirent avec leurs haines pour enfin vivre en paix sous le régne de Lacus Clyne.
Une nouvelle nation à fait surface, Hillys, ressemblant au plant, elle est seule et non 12.Elle a été construite pour permettre à tous ceux qui voulait la paix de la trouver.Hillys est constitué a 6O% d'eau.Elle ne possédent pas d'armé d'attaque mais de defense qui est trés puissante.Sa dirigeante est Deianeira.Less habitants d'Hillys sont appellés des Hillyen(nes)
Mais un groupe de coordinateurs ayant vuent les massacres du laboratoire de Londonia, la destruction des 3 plants et l'attentat sur Terre ont formés la 4e Reich dirigé par Verner.Au bout de deux ans, elle a finit par devenir l'un des plus importants groupes terroriste et le plus dangereux.Leur but detruire l'humanité pour en creer une meilleures.
Les 3 armés (Orb, Eaf, Zaft) et Hillys devront s'allier pour detruire se nouveau fléau.